中草藥保存必須在低溫的環境下貯存，存放時好能使用和呈防潮箱也可以用塑料袋將它層層包封以隔絕空氣。若經常取藥，可以將藥品制成小包裝，以免整體受潮；若長時間不用藥，可將藥品保存于冰箱中。
糖漿、口服液、合劑等易霉發酵的藥品，服用時先注意液體的澄明度、顏色是否發生變化，有否酸敗氣味，如果發現問題不能服用了。另外在開瓶后要及時用完，未用完的要密封，好置于冰箱中，但也不宜長期貯存。出現以下情況都不能服用：如散劑、沖劑、顆粒劑出現了結塊、變硬、變色；片劑、糖衣片出現發霉、變色、裂開；蜜丸出現干硬、開裂、發霉。
可以將藥品盛放在洗干凈的玻璃瓶中，然后蓋嚴瓶蓋，用蠟轉圈滴在瓶口處封嚴行了。如麝香、番紅花等有揮發性成分并具有特殊氣味、又極怕串味兒的藥，密封起來后，再放到冰箱中冷藏，不會散味兒了，而且這樣保存還可以起到防蟲的作用。對于像鹿茸等容易蟲蛀的藥，可以用少量當年的花椒跟它放一起，這種方法是很管用的。
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